Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp36B1AQJ2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp36B1AQJ2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms