Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmem238A9JSM3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms