Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttll11A4Q9F4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms