Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E8

Ttll6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll6A4Q9E8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll6A4Q9E8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms