Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E4

Ttll2, Probable tubulin polyglutamylase TTLL2, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll2A4Q9E4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttll2A4Q9E4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms