Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms