Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Atp8b5A3FIN4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Atp8b5A3FIN4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Atp8b5A3FIN4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Atp8b5A3FIN4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Atp8b5A3FIN4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Atp8b5A3FIN4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Atp8b5A3FIN4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Atp8b5A3FIN4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Atp8b5A3FIN4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Atp8b5A3FIN4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Atp8b5A3FIN4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Atp8b5A3FIN4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Atp8b5A3FIN4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Atp8b5A3FIN4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp8b5A3FIN4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Atp8b5A3FIN4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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