Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ism1A2ATD1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ism1A2ATD1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms