Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubb1A2AQ07 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms