Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SetxA2AKX3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SetxA2AKX3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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