Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm12A2AJ77 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms