Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pramel3A2AHA7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel3A2AHA7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms