Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34dA2AGU5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34dA2AGU5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms