Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc163A2AGD7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc163A2AGD7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms