Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pramef6A2A8M8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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