Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprfA2A8L5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms