Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdc27A2A6Q5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms