Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2cA2A6C4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms