Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms