Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms