Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms