Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P4

Ighv5-16, Immunoglobulin heavy variable 5-16 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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