Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv5A0A0B4J1G9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Trbv5A0A0B4J1G9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv5A0A0B4J1G9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv5A0A0B4J1G9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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