Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
AP5B1Q2VPB7 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271 ms