Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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COL4A6Q14031 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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