Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGB3BPQ13352 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.7 ms