Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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