Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.66
HOXA13P31271 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA13P31271 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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