Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRGP23470 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRGP23470 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms