Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTPREP23469 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPREP23469 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms