Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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UBXN4Q92575 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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UBXN4Q92575 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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UBXN4Q92575 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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UBXN4Q92575 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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