Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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USP18Q9UMW8 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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