Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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SYCP1Q15431 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SYCP1Q15431 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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