Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms