Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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