Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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