Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r10W4VSP8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms