Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms