Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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