Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc2Q9Z2H7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms