Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Pdpk1Q9Z2A0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Pdpk1Q9Z2A0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Pdpk1Q9Z2A0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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