Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Ilf3Q9Z1X4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ilf3Q9Z1X4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ilf3Q9Z1X4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Ilf3Q9Z1X4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ilf3Q9Z1X4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ilf3Q9Z1X4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ilf3Q9Z1X4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ilf3Q9Z1X4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ilf3Q9Z1X4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ilf3Q9Z1X4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ilf3Q9Z1X4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ilf3Q9Z1X4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms