Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddx39bQ9Z1N5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx39bQ9Z1N5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms