Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp2Q9Z0Z3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp2Q9Z0Z3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp2Q9Z0Z3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp2Q9Z0Z3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp2Q9Z0Z3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp2Q9Z0Z3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp2Q9Z0Z3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp2Q9Z0Z3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp2Q9Z0Z3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp2Q9Z0Z3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp2Q9Z0Z3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp2Q9Z0Z3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp2Q9Z0Z3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp2Q9Z0Z3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp2Q9Z0Z3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms