Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xpr1Q9Z0U0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xpr1Q9Z0U0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xpr1Q9Z0U0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xpr1Q9Z0U0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xpr1Q9Z0U0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xpr1Q9Z0U0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xpr1Q9Z0U0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xpr1Q9Z0U0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xpr1Q9Z0U0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xpr1Q9Z0U0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms