Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec2Q9WV35 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms