Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms