Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptpn4Q9WU22 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn4Q9WU22 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms