Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TapbpQ9R233 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms