Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed2Q9R0Q3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms